Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VhlP40338 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VhlP40338 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VhlP40338 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VhlP40338 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VhlP40338 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VhlP40338 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VhlP40338 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VhlP40338 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VhlP40338 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VhlP40338 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VhlP40338 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VhlP40338 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VhlP40338 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms