Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Timp3P39876 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Timp3P39876 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms