Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig1P37913 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig1P37913 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig1P37913 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig1P37913 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig1P37913 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig1P37913 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig1P37913 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms