Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PpargP37238 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PpargP37238 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PpargP37238 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PpargP37238 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PpargP37238 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpargP37238 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpargP37238 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpargP37238 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpargP37238 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpargP37238 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PpargP37238 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PpargP37238 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpargP37238 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpargP37238 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpargP37238 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpargP37238 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpargP37238 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpargP37238 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PpargP37238 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PpargP37238 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PpargP37238 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PpargP37238 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PpargP37238 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PpargP37238 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PpargP37238 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PpargP37238 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PpargP37238 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpargP37238 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpargP37238 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms