Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grin1P35438 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin1P35438 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grin1P35438 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin1P35438 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin1P35438 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin1P35438 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin1P35438 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms