Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptk2P34152 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms