Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola1P33609 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pola1P33609 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pola1P33609 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pola1P33609 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola1P33609 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pola1P33609 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pola1P33609 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pola1P33609 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pola1P33609 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola1P33609 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola1P33609 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola1P33609 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pola1P33609 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pola1P33609 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pola1P33609 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms