Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nedd1P33215 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd1P33215 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd1P33215 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms