Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SsbP32067 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SsbP32067 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SsbP32067 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SsbP32067 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SsbP32067 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SsbP32067 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SsbP32067 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SsbP32067 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SsbP32067 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SsbP32067 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SsbP32067 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SsbP32067 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SsbP32067 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SsbP32067 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SsbP32067 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SsbP32067 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SsbP32067 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SsbP32067 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SsbP32067 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SsbP32067 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SsbP32067 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SsbP32067 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SsbP32067 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SsbP32067 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SsbP32067 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SsbP32067 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SsbP32067 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SsbP32067 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SsbP32067 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SsbP32067 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SsbP32067 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SsbP32067 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SsbP32067 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SsbP32067 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SsbP32067 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SsbP32067 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SsbP32067 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SsbP32067 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SsbP32067 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SsbP32067 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SsbP32067 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SsbP32067 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SsbP32067 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SsbP32067 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SsbP32067 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SsbP32067 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SsbP32067 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SsbP32067 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SsbP32067 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SsbP32067 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SsbP32067 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SsbP32067 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SsbP32067 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SsbP32067 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SsbP32067 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SsbP32067 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SsbP32067 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SsbP32067 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms