Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc5P32043 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc5P32043 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms