Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa11P31311 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa11P31311 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms