Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctnnd1P30999 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms