Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NapbP28663 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NapbP28663 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NapbP28663 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NapbP28663 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NapbP28663 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NapbP28663 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NapbP28663 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NapbP28663 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NapbP28663 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NapbP28663 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NapbP28663 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NapbP28663 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NapbP28663 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NapbP28663 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NapbP28663 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NapbP28663 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NapbP28663 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NapbP28663 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NapbP28663 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NapbP28663 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NapbP28663 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NapbP28663 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NapbP28663 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NapbP28663 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NapbP28663 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NapbP28663 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NapbP28663 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NapbP28663 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NapbP28663 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NapbP28663 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapbP28663 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapbP28663 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapbP28663 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NapbP28663 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapbP28663 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapbP28663 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapbP28663 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapbP28663 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapbP28663 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NapbP28663 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapbP28663 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapbP28663 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapbP28663 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapbP28663 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NapbP28663 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapbP28663 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NapbP28663 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapbP28663 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapbP28663 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapbP28663 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapbP28663 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapbP28663 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapbP28663 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NapbP28663 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NapbP28663 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NapbP28663 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NapbP28663 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NapbP28663 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NapbP28663 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NapbP28663 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapbP28663 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapbP28663 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapbP28663 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapbP28663 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapbP28663 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NapbP28663 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NapbP28663 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms