Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aco1P28271 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aco1P28271 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aco1P28271 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aco1P28271 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aco1P28271 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aco1P28271 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms