Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Twist1P26687 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Twist1P26687 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms