Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccnd1P25322 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms