Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf1bP25119 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms