Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd247P24161 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd247P24161 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd247P24161 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms