Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Mdm2P23804 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mdm2P23804 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms