Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata3P23772 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata3P23772 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata3P23772 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata3P23772 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata3P23772 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata3P23772 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata3P23772 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata3P23772 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata3P23772 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata3P23772 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata3P23772 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata3P23772 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata3P23772 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata3P23772 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata3P23772 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata3P23772 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gata3P23772 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gata3P23772 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms