Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfyaP23708 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NfyaP23708 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NfyaP23708 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms