Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PparaP23204 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PparaP23204 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PparaP23204 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PparaP23204 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PparaP23204 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PparaP23204 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PparaP23204 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PparaP23204 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PparaP23204 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PparaP23204 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PparaP23204 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PparaP23204 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PparaP23204 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PparaP23204 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PparaP23204 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PparaP23204 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PparaP23204 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PparaP23204 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PparaP23204 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PparaP23204 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PparaP23204 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PparaP23204 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PparaP23204 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PparaP23204 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PparaP23204 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PparaP23204 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PparaP23204 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PparaP23204 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PparaP23204 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PparaP23204 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PparaP23204 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PparaP23204 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PparaP23204 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PparaP23204 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PparaP23204 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PparaP23204 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PparaP23204 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PparaP23204 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PparaP23204 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PparaP23204 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PparaP23204 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PparaP23204 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PparaP23204 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PparaP23204 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PparaP23204 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PparaP23204 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PparaP23204 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PparaP23204 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms