Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clk1P22518 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clk1P22518 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clk1P22518 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clk1P22518 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk1P22518 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms