Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcb4P21440 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcb4P21440 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms