Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gna11P21278 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gna11P21278 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms