Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChrneP20782 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChrneP20782 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChrneP20782 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChrneP20782 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChrneP20782 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChrneP20782 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChrneP20782 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ChrneP20782 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChrneP20782 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChrneP20782 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChrneP20782 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms