Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabra6P16305 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra6P16305 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms