Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl1P12850 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms