Protein–RNA interactions for Protein: P12815

Pdcd6, Programmed cell death protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6P12815 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdcd6P12815 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcd6P12815 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd6P12815 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd6P12815 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcd6P12815 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms