Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamp1P11438 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamp1P11438 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms