Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col1a1P11087 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col1a1P11087 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a1P11087 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms