Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd4P10628 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxd4P10628 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd4P10628 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms