Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl2P10148 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl2P10148 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms