Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd7P0C872 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jmjd7P0C872 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jmjd7P0C872 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms