Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf1P09925 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf1P09925 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf1P09925 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf1P09925 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms