Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LtaP09225 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LtaP09225 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LtaP09225 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtaP09225 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtaP09225 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtaP09225 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtaP09225 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtaP09225 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtaP09225 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LtaP09225 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LtaP09225 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LtaP09225 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtaP09225 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LtaP09225 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtaP09225 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtaP09225 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtaP09225 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtaP09225 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LtaP09225 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LtaP09225 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LtaP09225 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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