Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd3P09027 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms