Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Col3a1P08121 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col3a1P08121 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms