Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ifna4P07351 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna4P07351 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms