Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CfhP06909 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CfhP06909 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CfhP06909 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CfhP06909 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CfhP06909 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CfhP06909 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CfhP06909 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CfhP06909 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CfhP06909 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CfhP06909 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CfhP06909 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfhP06909 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfhP06909 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfhP06909 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfhP06909 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfhP06909 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfhP06909 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CfhP06909 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfhP06909 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CfhP06909 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CfhP06909 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CfhP06909 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CfhP06909 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CfhP06909 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CfhP06909 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CfhP06909 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CfhP06909 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CfhP06909 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CfhP06909 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CfhP06909 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CfhP06909 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CfhP06909 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CfhP06909 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CfhP06909 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CfhP06909 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CfhP06909 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CfhP06909 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CfhP06909 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CfhP06909 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CfhP06909 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CfhP06909 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CfhP06909 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CfhP06909 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CfhP06909 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CfhP06909 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CfhP06909 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CfhP06909 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CfhP06909 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CfhP06909 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CfhP06909 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CfhP06909 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CfhP06909 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfhP06909 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfhP06909 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfhP06909 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfhP06909 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfhP06909 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfhP06909 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfhP06909 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfhP06909 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CfhP06909 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CfhP06909 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CfhP06909 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms