Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc4a1P04919 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc4a1P04919 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc4a1P04919 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc4a1P04919 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a1P04919 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a1P04919 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a1P04919 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a1P04919 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms