Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd3dP04235 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd3dP04235 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms