Protein–RNA interactions for Protein: P02469

Lamb1, Laminin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb1P02469 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lamb1P02469 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamb1P02469 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms