Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-Ab1P01921 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms