Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01801 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01801 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01801 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01801 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01801 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01801 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01801 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01801 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01801 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01801 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01801 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01801 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01801 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01801 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01801 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01801 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01801 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01801 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01801 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01801 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01801 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01801 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01801 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01801 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01801 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01801 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01801 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01801 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01801 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01801 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01801 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01801 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01801 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01801 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01801 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01801 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01801 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01801 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01801 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01801 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01801 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01801 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01801 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms