Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01783 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01783 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01783 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01783 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01783 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01783 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01783 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01783 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01783 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01783 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01783 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms