Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01748 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01748 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01748 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01748 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01748 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01748 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01748 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01748 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01748 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01748 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01748 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01748 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01748 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01748 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01748 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01748 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01748 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01748 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01748 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01748 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01748 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01748 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01748 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01748 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01748 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01748 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01748 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01748 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01748 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01748 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01748 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms