Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01739 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01739 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01739 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01739 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01739 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01739 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01739 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01739 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01739 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01739 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01739 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01739 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01739 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01739 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01739 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01739 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01739 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01739 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01739 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01739 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01739 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01739 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01739 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01739 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01739 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01739 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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