Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01734 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01734 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01734 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01734 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01734 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01734 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01734 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01734 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01734 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01734 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01734 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01734 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01734 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01734 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01734 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01734 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01734 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01734 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01734 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01734 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01734 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01734 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01734 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01734 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01734 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01734 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P01734 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01734 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01734 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01734 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01734 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms