Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01727 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01727 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01727 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01727 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01727 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01727 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01727 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01727 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01727 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01727 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01727 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01727 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01727 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01727 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01727 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01727 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01727 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01727 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01727 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01727 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01727 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01727 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01727 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01727 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01727 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01727 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01727 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01727 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01727 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01727 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01727 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01727 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01727 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms